En sesión plenaria del 04 de octubre de 2017, el Consejo Superior decidió adherir, conjuntamente con la Universidad Nacional de Rosario, al repudio del ingreso de Gendarmería Nacional en el predio del Centro Universitario Rosario mientras se celebraba un acto al cumplirse dos meses de la desaparición de Santiago Maldonado.

Este ingreso no contó con el aval ni la autorización de ninguna autoridad judicial ni universitaria, tal como lo exige el artículo 31 de la Ley de Educación Superior 24.521. El episodio se suma a acontecimientos similares acontecidos este año en las Universidades de Jujuy y de San Juan, hecho que debe llamar la atención de la comunidad universitaria.